您好，泛基因家族分析是基于泛基因组的结果进行的，您图中的pan-gene.list文件是泛基因组的分析结果，详见《De novo assembly, annotation, and comparative analysis of 26 diverse maize genomes》中提供的泛基因结果材料，至于说的只提取到了一个基因这个情况，如果您是完全用我们的示例数据去跑的话不会有这个问题，建议检查一下之前的步骤。如果您是自己重新选择了一个基因家族做泛基因家族分析，如果您前面的分析没有问题的话，那可能您的目标基因家族没有被整合进泛基因列表中，建议再找找别的玉米泛基因组数据