运行mcmctree报错2.0

补充:使用的是是组学大讲堂的镜像,用singularity调用的,前一步顺利运行,这一步报错的


麻烦老师尽快再回答一下吧!!卡在这里好几天了!!!


或者能不运行mcmctree,用别的什么结果运行cafe5吗

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11.time_tree_BV_2.sh.o 日志文件显示如下
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 mcmctree mcmctree1.ctl >run1.o 日志文件显示如下:

PAML 软件中的 MCMCTREE 工具, finetune 参数现在已经被废弃了。

attachments-2024-05-4yu7Xb99663d840d70bfd.png————————-——

mcmctree mcmctree2.ctl > run2.o 日志文件显示如下:

1.  PAML 软件中的 MCMCTREE 工具, finetune 参数现在已经被废弃了。

2. 说这个物种不在master tree上,这个物种是我指定的外群

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1 个回答

omicsgene - 生物信息
擅长:重测序,遗传进化,转录组,GWAS

高效的提问应该把所有输入文件命令行都贴一下,最后再贴报错信息,初学者大多都是输入文件格式错误导致报错;


看你的贴图:

输入文件格式问题吧,你把你的输入文件都贴图一下,检查是否格式错误导致软件报错;

这里标记化石时间错了,一般标记枝的分离时间(标记在括号的后面),你这个标记到物种了,标记错了,你再看看课程对比一下示例和讲解吧;

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