高效的提问应该把所有输入文件命令行都贴一下,最后再贴报错信息,初学者大多都是输入文件格式错误导致报错;
看你的贴图:
输入文件格式问题吧,你把你的输入文件都贴图一下,检查是否格式错误导致软件报错;
这里标记化石时间错了,一般标记枝的分离时间(标记在括号的后面),你这个标记到物种了,标记错了,你再看看课程对比一下示例和讲解吧;
补充:使用的是是组学大讲堂的镜像,用singularity调用的,前一步顺利运行,这一步报错的
麻烦老师尽快再回答一下吧!!卡在这里好几天了!!!
或者能不运行mcmctree,用别的什么结果运行cafe5吗
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11.time_tree_BV_2.sh.o 日志文件显示如下
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mcmctree mcmctree1.ctl >run1.o 日志文件显示如下:
PAML 软件中的 MCMCTREE 工具, finetune 参数现在已经被废弃了。
mcmctree mcmctree2.ctl > run2.o 日志文件显示如下:
1. PAML 软件中的 MCMCTREE 工具, finetune 参数现在已经被废弃了。
2. 说这个物种不在master tree上,这个物种是我指定的外群