老师您好,做完蛋白序列多序列比对后,分析基因家族的保守位点,怎么判断那段保守位点指的哪个氨基酸活性位点呢,然后画出像文献中这样的图

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1 个回答

omicsgene - 生物信息
擅长:重测序,遗传进化,转录组,GWAS

多看看自己研究的家族保守结构域的特点,再看看比对后序列上保守的碱基就知道了;

例如下面的,WRKY比对结果,一看WRKY就知道了:attachments-2024-05-QJUNCCxU665535ec5dd6d.png


再对比一下 WRKY保守结构域的motif,就知道了,红色箭头处保守的氨基酸:attachments-2024-05-th0iE2Df6655366289b40.png


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