泛基因家族ka/ks分析,生成 .axt文件时报错,查看直播回放发现老师是cp过去的结果,我按步骤怎么都做不出来,中间没少任何一步

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2 个回答

海涛

运行前面指令液没有生成。axt文件


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每天学习一点点

这就有点奇怪了,由于同学你提出了这个问题,我重新跑了一下流程里ParaAT比对的这一步,就是你贴出来的这条指令:

attachments-2024-06-tJ99Wcyw667abc2d8bf52.png

是能够跑出来有结果的axt文件的,这是运行中会产生的一些日志内容,你的运行过程也是这样的吗:

attachments-2024-06-AHXXpf8K667cce375b534.png结果axt:

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所以现在我也不是很清楚为什么你会出现这种跑出来空的结果文件的问题,空的结果会不会是没跑完呢?因为他这个基因数量有点多,可能得多跑一会。
而且同学,如果这个里面有些基因没跑出来是正常的哈,因为这些基因在基因组之间是不成对的,这个我在直播的时候讲过,但如果都没有就不太对劲
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  • 海涛 提出于 2024-06-25 20:49

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