单细胞测序数据进行细胞通讯分析

进行猪样本的单细胞测序数据进行细胞通讯分析时,cellphonedb method statistical_analysis meta.tsv normalize.data.tsv \

  --counts-data hgnc_symbol   --iterations=100 --threads=1,这个代码里面 --counts-data hgnc_symbol 中的"hgnc_symbol"需要修改吗?改为什么?谢谢老师。

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1 个回答

omicsgene - 生物信息
擅长:重测序,遗传进化,转录组,GWAS

细胞通讯不支持猪的样本,这个分析猪做不了; 因为没有猪对应的配受体数据库

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  •  提出于 2024-06-28 13:39

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