那可以这样写： --ident.2 不设置即可
Rscript $scripts/seurat_FindMarkers.r --rds $workdir/05.cell_type_ann/pbmc.added.celltype.rds \
-p FindMarkers --ident.1 "CD4 Naive T" --test.use DESeq2 --logfc.threshold 0.25
可以这样看看脚本帮助：
单细胞测序数据差异分析
#不同类型细胞差异比较：
Rscript $scripts/seurat_FindMarkers.r --rds $workdir/05.cell_type_ann/pbmc.added.celltype.rds \
-p FindMarkers --ident.1 "CD4 Naive T" --ident.2 "B" --test.use DESeq2 --logfc.threshold 0.25
这里只能进行两两分析吗？--ident.2后面可不可以加多种细胞类型的名称，即"CD4 Naive T"与剩下的其它所有Cluster分析？如果想这样分析应该怎么操作？
