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蛋白三级结构分析时,用PSI-blast和SWISS-MODEL自带的模板同时做了,发现SWISS-MODEL自带的模板做出来的相似度更高、GMQE和QMEAN值也更好,同时,两个方法也有重复的模板,想问问老师应该选择相似度更高的,还是选择两种方法都有的模板?
蛋白三维结构预测
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基因家族分析
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rzx
2024-07-26 11:24
相似度更高,结果更好的。不过具体可以看一下模板序列和自己序列比对上的区域。另外PSIblast也可以调大-max_target_seqs参数看有没有比对上你想要的模板
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幸运女神保佑我
提出于 2024-07-16 14:17
相似问题
蛋白三维结构预测swiss-model中搜索模型的时候,搜索到模版相似性最高的是算法得到,相对低的那个是试验证实的,应该选哪个构建模型
1 回答
蛋白三维结构预测遇到问题:当在swiss-model中选择使用模板的方法时,在上传模板的时候发现因为以下问题没法上传
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