蛋白三级结构分析时，用PSI-blast和SWISS-MODEL自带的模板同时做了，发现SWISS-MODEL自带的模板做出来的相似度更高、GMQE和QMEAN值也更好，同时，两个方法也有重复的模板，想问问老师应该选择相似度更高的，还是选择两种方法都有的模板？ - 组学大讲堂问答社区

5 蛋白三级结构分析时，用PSI-blast和SWISS-MODEL自带的模板同时做了，发现SWISS-MODEL自带的模板做出来的相似度更高、GMQE和QMEAN值也更好，同时，两个方法也有重复的模板，想问问老师应该选择相似度更高的，还是选择两种方法都有的模板？

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分类：基因家族分析

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1 个回答

rzx 2024-07-26 11:24

相似度更高，结果更好的。不过具体可以看一下模板序列和自己序列比对上的区域。另外PSIblast也可以调大-max_target_seqs参数看有没有比对上你想要的模板

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幸运女神保佑我提出于 2024-07-16 14:17