老师 就是在计较基因组学哪里 请问一下下面这些物种的这些物种怎么下载它的genome.fasta和gff3啊 我在ensemble plant和jgi上都没找到,而且在ncbi上找到下载啦 打不开,,这种要怎么解决啊,

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1 个回答

Ti Amo

如果打包下载的zip有问题,尝试在服务器使用FTP地址使用wget进行下载,具体下载指令如下:

下载基因组: wget https://ftp.ncbi.nlm.nih.gov/genomes/all/GCF/004/153/795/GCF_004153795.1_AHAU_CSS_1/GCF_004153795.1_AHAU_CSS_1_genomic.fna.gz -O Camellia_sinensis.fa.gz 

下载gff:wget https://ftp.ncbi.nlm.nih.gov/genomes/all/GCF/004/153/795/GCF_004153795.1_AHAU_CSS_1/GCF_004153795.1_AHAU_CSS_1_genomic.gff.gz  -O Camellia_sinensis.gff3.gz 


获取地址方式如下:

点击进入这个基因组的详情界面:

attachments-2024-08-DHBKS5hz66b979da177f4.png

到FTP界面:

attachments-2024-08-sijijz3m66b97a45511a6.png

attachments-2024-08-QaiytYUy66b97ae9b79c7.png

鼠标放在这两个文件上右键选择复制下载链接,再到服务器使用wget下载即可。wget使用指令见上文。

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  • 烟雨易冷 提出于 2024-08-10 19:17

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