这种所有样本丰度都为0的otu可以过滤吗，我筛选提取了分组之后发现有一些otu在我选的分组里都为0，就是这一步“df_sub=df[,rownames(fastmap_sub) ]”，我过滤了所有列为0的otu，同时也更新了taxonomy_sub，然后进行后续的分析，这一步可以过滤吧？然后我另外筛选出别的组再根据那个组的数据过滤，这一步 过滤 掉该组所有样本都为0的otu是不会影响结果的吧？
当然可以,倒不如说肯定要过滤的,我记得我们的默认代码里是有过滤的,而且比你的要严格
这种所有样本丰度都为0的otu可以过滤吗，我筛选提取了分组之后发现有一些otu在我选的分组里都为0，就是这一步“df_sub=df[,rownames(fastmap_sub) ]”，我过滤了所有列为0的otu，同时也更新了taxonomy_sub，然后进行后续的分析，这一步可以过滤吧？然后我另外筛选出别的组再根据那个组的数据过滤，这一步 过滤 掉该组所有样本都为0的otu是不会影响结果的吧？