基因家族鉴定

这次用默认的参数跑到蛋白序列比对,发现有很多不全和缺失的,如图attachments-2024-08-24ubsCaf66d026c330699.png,比如第一条就没有锌指结构,返回查看原始序列都是没有的,准备删掉,后面几条也是连WRKYGQK结构都不全,也准备删掉,但是前面在数据库查看的时候为何不全的结构还是会显示WRKY结构域呢?还有一些序列比如attachments-2024-08-8gssxMax66d0278e11f62.png这条,一条链是WRKYGQK完整结构,另外一条不是,但是最后显示的是另外一条不完整结构的WRKYGKK,可以选择另外一条完整的链展示吗,还是因为这条不完整结构的链才是翻译的链所以才在这显示的。

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1 个回答

rzx

在线数据库筛选问题,可能残缺的基因家族结构域也会识别出来。可以做多序列比对,不想要的结果就删掉。

另外在线数据库的结构域区域展示中,上面那条序列是自己输入的序列,下面的序列是数据库里的序列。不是自己想选那条的问题。

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  • 御坂妹110 提出于 2024-08-29 15:50

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