变异结果统计与绘图时,最后一步出现Error in scan(file = file, what = what, sep = sep, quote = quote, dec = dec, : line 17 did not have 34 elements的问题,查看文件发现并没有缺失的部分,怎么解决

运行Rscript $scriptdir/var_density.R -i snp.unknown_multianno.vcf  -b 1000000 -c "darkgreen,yellow,red" -t "SNP Density"这条代码后出现Error in scan(file = file, what = what, sep = sep, quote = quote, dec = dec,  :

  line 17 did not have 34 elements的问题,

查看了第17行,34个元素都在,并没有缺失

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1 个回答

omicsgene - 生物信息
擅长:重测序,遗传进化,转录组,GWAS

文件格式有问题吧,看看有没有特殊字符啥的;

或者截图看看的;

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  • starry. 提出于 2024-08-31 22:54

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