LTR注释相关疑问

老师您好,我使用LTR_HARVEST_parallel、LTR_FINDER_parallel以及LTR_retriever步骤进行LTR注释,但最终打开结果文件ref.fa.mod.LTRlib.fa只有性染色体的注释结果,这是为什么?在进行LTR_retriever有一些报错如下attachments-2024-09-yFKumWRH66de5b98b1be7.pngattachments-2024-09-DUejXXx066de5bb17c020.png

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1 个回答

Ti Amo

1.检查一下LTR_HARVEST_parallel、LTR_FINDER_parallel的结果是否完整

2.未能生成tbl文件,生成tbl需要调用RepeatMasker,确认你的环境里有这个软件

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