10 单细胞拎亚群后重新聚类分析，需要重新整合吗
有点不理解06.subset的代码，重新分析和03. seurat_cluster的代码很不一样，不用选integration的方法，也不用设置resolution和dimension。是因为rds文件已经包含了嘛？看运行过程，在reanalysis的时候，runpca前还是用log-transformation标准化了一下，这又是为什么呢？
我只拎了tumor cell这个cluster出来，然后reanalysis的umap感觉不同代数细胞好像是单独成簇的，正常嘛？
最佳答案 2024-09-11 13:40
subset 仅仅只取子集，没有做其他聚类分群分析；如果有聚类分群结果也是之前的结果；
如果要重新聚类分析可以把这个subset的rds文件输入：03. seurat_cluster
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