请问老师我跟着重测序课程做到了VCF过滤这步,是不是三种方法任意使用一种方法过滤就好.

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#过滤1：gatk VariantFiltration #过滤2：vcfutils.pl #过滤3：vcftools 请问老师这三种工具是不是选择任意一种进行就好,还是按照课程这三步骤都要运行一遍.

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1 个回答

守得云开雾现。 2024-10-07 15:35

老师最后一步vcftools我过滤5G的数据只得到了10M的数据，这步是不是可以省略不做了。