成功得到了gvcf文件后,合并gvcf文件时,在导入db步骤中,由于gvcf文件超出了idx索引的处理范围,因此我使用CSI建立索引后,发现导入db的代码依旧无法运行,需要idx格式的索引,怎么办

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1 个回答

rzx

使用GATKA中的 IndexFeatureFile 工具来构建索引。gatk --java-options "-Xmx50g"  IndexFeatureFile -I  **.g.vcf.gz

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