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按照您昨天提供的IndexFeatureFile 工具来构建gvcf文件索引时,依旧出现报错现象,无法索引,怎么办
索引
gvcf
GATK
index
0 条评论
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重测序
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安生水
1天前
擅长:perl,基因家族,linux,chip-seq
如果你的样品少,可以用gatk直接生成vcf文件,就不要生成gvcf了
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啊呀。
提出于 3天前
相似问题
老师,问题比较复杂,麻烦您看一下详细的问题描述,小麦基因组
1 回答
老师,我有141个样品,现在IndexFeatureFile,tabix,bcftools都无法成功构建gvcf的索引,只有CSI格式能成功索引,这个格式在后续也用不了,这个gvcf索引还有其他的解决办法嘛,还是说我只能重新生成vcf文件了
1 回答
成功得到了gvcf文件后,合并gvcf文件时,在导入db步骤中,由于gvcf文件超出了idx索引的处理范围,因此我使用CSI建立索引后,发现导入db的代码依旧无法运行,需要idx格式的索引,怎么办
2 回答
老师,我按照多样本的代码生成gvcf文件后,发现并没有视频里讲解所说的tbi格式的索引文件,这是怎么回事呢,我需要怎么做啊
1 回答
用GATK call SNP时报错
1 回答
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