你这个信息截图不全，没发现有什么异常的报错；
最后的信息也是warn警告信息，不影响结果的；
看一下服务器内存是多少，内存不够运行样本太多也会报错；
free -h #查看内存
老师，您好，我在运行gatk的HaplotypeCaller时，因为样本过多（二三百个样本），运行成功的单个样本运行了24+个小时，尝试了采用ParaFly工具多任务并行，并且也尝试了同时运行多个nohup sh gatk.g.sh > gatk.g.sh.o&（一个gatk.g.sh对应一个样本），但是都是在十几分钟后终止进程了，查看了其中一个gatk.g.sh.o文件，文件内容如下，烦请老师帮忙提出问题及解决方法，非常感谢
2 个回答
老师您好，应该就是我占用内存太多了，上传的任务太多了。
老师，我还想请教一下， 我去问了我们学院做重测序的师弟，他说最多也就放5个，他是2G基因组，也是10X的，但是他一个样本就是占用400%的CPU，七八个小时就结束了，我的基因组是1.37G的，10X的测序，我现在的一个样本是差不多150%-200%的CPU，按之前的经验也要两天，我想问问我的服务器CPU可以调吗？要不我都不敢进我的账号，一进去docker就下线，后台的进程就全终止了，这两天有个进程正在运行，我怕重启docker所以都不敢进我的服务器账号，现在才来回复，非常抱歉
我租用的就是组学大讲堂的服务器，是双路CPU，96 线程，512G 内存，48T 存储，Raid10，独享的服务器， 非常感谢您啦