seqclean出错

这个错误信息

* Using trimming files:


/work/12.EVM/00.data/UniVec

seqclean running options:

seqclean genome.repeat.fa -c 1 -n 10000 -v UniVec

 Standard log file: seqcl_genome.repeat.fa.log

 Error log file:    err_seqcl_genome.repeat.fa.log

 Using 1 CPUs for cleaning

-= Rebuilding genome.repeat.fa cdb index =-

 Launching actual cleaning process:

 psx -p 1  -n 10000  -i genome.repeat.fa -d cleaning -C '/work/12.EVM/00.data/genome.repeat.fa:ANLMS100:/work/12.EVM/00.data/UniVec::11:0' -c '/share/work/biosoft/PASApipeline/PASApipeline-v2.5.2/bin/seqclean.psx'

Error at 'psx -p 1  -n 10000  -i genome.repeat.fa -d cleaning -C '/work/12.EVM/00.data/genome.repeat.fa:ANLMS100:/work/12.EVM/00.data/UniVec::11:0' -c '/share/work/biosoft/PASApipeline/PASApipeline-v2.5.2/bin/seqclean.psx''



Process terminated with an error!

seqclean (genome.repeat.fa) encountered an error.

Working directory was /work/12.EVM/00.data

seqclean (genome.repeat.fa) encountered an error.

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2 个回答

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已添加export USER='me'  

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Ti Amo

看一下这个文件里面有什么:err_seqcl_genome.repeat.fa.log

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  • 小文 提出于 2024-10-28 19:19

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