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老师,在第三步vcf文件过滤时,得到的all.clean.vcf文件太小了,宽松设置调整数值后,依旧很小,怎么办啊,有没有其他的方法,可以让最后的数据大一些啊
变异结果过滤
vcftools
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分类:
重测序
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1 个回答
omicsgene
- 生物信息
2024-11-07 09:20
擅长:重测序,遗传进化,转录组,GWAS
--minGQ 这个参数一般不设置,你去掉试试 , 他过滤的很严格;
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啊呀。
提出于 2024-11-06 23:46
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