可以把命令写到一个sh文件里面,然后nohup后台运行;
购买我们的服务器登录的时候有个操作手册链接里面有说明,你可以学习一下;
我再你们服务器上运行一些重测序命令的时候,例如,for i in $(cat $workdir/data/data.txt); do
echo "RUN CMD: fastp --thread 50 --qualified_quality_phred 10 \
--unqualified_percent_limit 50 \
--n_base_limit 10 \
-i $datadir/${i}_1.fastq.gz \
-I $datadir/${i}_2.fastq.gz \
-o ${i}_1.clean.fastq.gz \
-O ${i}_2.clean.fastq.gz \
--detect_adapter_for_pe \
-h ${i}.html -j ${i}.json"
fastp --thread 50 --qualified_quality_phred 10 \
--unqualified_percent_limit 50 \
--n_base_limit 10 \
-i $datadir/${i}_1.fastq.gz \
-I $datadir/${i}_2.fastq.gz \
-o ${i}_1.clean.fastq.gz \
-O ${i}_2.clean.fastq.gz \
--detect_adapter_for_pe \
-h ${i}.html -j ${i}.json \
done
由于我的样本比较比较多,这个命令运行一半就会断开,有什么方法可以阻止这个命令断开?