老师您好，我按照t2t的课程组装了两个单倍型hap1跟hap2,两个单倍型跟同一个参考基因组比较，结果都比较好，但是将hap1跟hap2比较，8.9号染色体结果就不好，这种情况正常吗？
hap1与参考基因组比较
hap2与参考基因组比较
hap1与hap2比较
调整-m -q，这两个参数过大会导致有比对片段未被计算。从图形上两个单倍型8、9号的染色体比对没有问题
