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请教一下TCGA的蛋白数据怎么理解,它是有正负值的,这个正负值代表什么意思,为什么蛋白表达会有负值?我只想给它分成高表达,低表达和表达缺失组应该怎么处理呀?
TCGA
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卡西莫多
提出于 2天前
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老师,想请教一下TCGA基因表达数据的问题,我从xena.ucsc网页上下载了基因表达数据TCGA-CESC.htseq_counts.tsv;然后发现该数据中只有Ensembl格式的基因ID ,没有SYMBOL格式的。所以接下来进行基因ID格式转换,却发现同一个SYMBOL ID对应的多个Ensembl格式的ID,想问下老师,这种情况该怎么处理?同一个SYMBOL ID所对应的多个Ensembl格式ID的基因表达数据应该留下哪一个?
1 回答
TCGA的RNA-seq count annotation过滤,有些不知道是否需要删除
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