泛基因,SV ,VCF文件格式为4.2 ,没有课程里要求的SUPP_VEC和SVLEN信息,怎么改?会影响后面分析吧?

attachments-2024-12-FgykoJeW675a5eaa6c0a6.pngattachments-2024-12-quC39OSv675a5eb175b15.png这个是我的VCF文件,注释信息里也没有课程要求的信息,应该怎么弄?

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1 个回答

每天学习一点点

课程里面的SV结果是分样本做SV calling后,使用merge合并的结果,你的这个格式确实与课程里的不一样,需要写代码手动提取一下有用的信息

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