20 群体遗传构建进化树格式转换报错

老师好,请问我在群体遗传分析构建进化树这一步运行转换为phy格式的文件,“run_pipeline.pl  -Xmx180G -importGuess  $workdir/00.filter/clean.vcf.gz  -ExportPlugin -saveAs supergene.phy -format Phylip_Inter” 得到了如下结果,一直提示不能有染色体名称为空的行,但是我检查了我的vcf文件,第一列没有是空的行啊,请问这种情况怎么解决?



attachments-2024-12-04G3YmYm677255ae15ebf.png


请先 登录 后评论

1 个回答

Mr.Black

解决了,vcftools过滤完最后有2行记录信息没有#注释,一行是从多少位点中过滤出多少位点,一行是用时多久,把这两行删掉就好了

请先 登录 后评论