hmmsearch 关于参数--cut_tc设置

老师好,在鉴定C2H2类的转录因子时,我先使用命令:hmmsearch --domtblout C2H2_hmm_out.txt --cut_tc PF00096.hmm pep.fa搜索,其次用已经功能鉴定的拟南芥和番茄的同源序列做blast,两者得到的结果没有交集。我发现在删除参数--cut_tc后得到的hmmer结果与blast结果有交集且结果基本一致。请问这个--cut_tc参数设置和不设置有什么区别,什么时候设置,什么时候不设置这个参数呢?麻烦各位老师帮忙解答。

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  • 单恋一枝花 提出于 2025-01-02 15:38

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