用三代数据sv结果对二代数据进行基因分型，合并两个结果时出现问题，bcftools merge合并的结果，缺失率太大，导致用plink进行pca分析时因缺失率太高无法进行，survivor merge 1000 1 1 0 0 50，合并后样本名减少，并且计算Fst为几个固定值。不知道要如何处理，希望能收到答复。谢谢
建议附上合并之后的vcf截图，需要info列的截图和后面的基因型截图。
sv的vcf其“存在与否”信息在info列，可以根据info列自行进行基因型的转换，变成正常0/0 1/1这种基因型之后进行后续分析。
