老师 就是 我在过滤数据的时候 下面截屏中利用vcfutils.pl进行过滤的时候 生成的文件还有7.2 Gb,但是用vcftools进行过滤后还剩764Mb的文件,这个是不是过滤掉的太多啦呀 麻烦您重新帮我设置一个过滤参数嘛 谢谢我重测序的个体才36个

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1 个回答

omicsgene - 生物信息
擅长:重测序,遗传进化,转录组,GWAS

--minGQ 80   这个参数去掉试试,这个参数过滤的比较狠;

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