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老师,请问您们一下,我有使用McScan的经验,但是McScanX的是由方法有些地方不是很懂?
MCScanX
$$ blastall -i query_file -d database –p blastp –e 1e-10 –b 5 –v 5 –m 8 –o xyz.blast 是什么意思呢?
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2018-08-02 02:00
这条代码是 blast 比对:
query_file:替换自己查询fasta序列文件,使用的是blastp,输入文件为蛋白质序列;
database:输入blast比对数据库文件路径;
xyz.blast:输出文件
其他参数默认照抄就好了
更详细的可观看:《
基因家族视频课程
》有详细操作说明。
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omicsgene
- 生物信息
擅长:重测序,遗传进化,转录组,GWAS | 采纳率 8% | 回答于 2018-07-18 09:52
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提出于 2018-07-17 19:44
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