发现
问答
发起
提问
文章
文章
更多
专家
讲堂
话题
财富榜
商城
Toggle navigation
首页
(current)
问答
文章
视频课程
话题
商城
搜索
登录
注册
5
老师,请问您们一下,我有使用McScan的经验,但是McScanX的是由方法有些地方不是很懂?
MCScanX
$$ blastall -i query_file -d database –p blastp –e 1e-10 –b 5 –v 5 –m 8 –o xyz.blast 是什么意思呢?
0 条评论
分类:
软件工具
请先
登录
后评论
最佳答案
2018-08-02 02:00
这条代码是 blast 比对:
query_file:替换自己查询fasta序列文件,使用的是blastp,输入文件为蛋白质序列;
database:输入blast比对数据库文件路径;
xyz.blast:输出文件
其他参数默认照抄就好了
更详细的可观看:《
基因家族视频课程
》有详细操作说明。
0 条评论
0
打赏
请先
登录
后评论
×
如果觉得我的回答对您有用,请随意打赏。你的支持将鼓励我继续创作!
omicsgene
- 生物信息
擅长:重测序,遗传进化,转录组,GWAS | 采纳率 8% | 回答于 2018-07-18 09:52
默认排序
时间排序
其它 0 个回答
您需要登录后才可以回答问题,
登录
或者
注册
关注
1
关注
收藏
0
收藏,
4704
浏览
不一样
提出于 2018-07-17 19:44
相似问题
在共线性分析中发现结果太少
1 回答
mcscanX运行报错
1 回答
做基因家族共线性分析时,collinearity文件是空的,可能是什么问题。
1 回答
多物种共线性分析最后一步报错
1 回答
共线性分析代码报错
1 回答
请问在运行MCSCANX查找共线性时出现这个html文件是这样的,是怎么回事,是用的gff和blast文件有错吗
1 回答
×
发送私信
发给:
内容:
×
举报此文章
垃圾广告信息:
广告、推广、测试等内容
违规内容:
色情、暴力、血腥、敏感信息等内容
不友善内容:
人身攻击、挑衅辱骂、恶意行为
其他原因:
请补充说明
举报原因: