重测序

我现在在做重测序数据比对和call SNP 分析,有个问题我想咨询一下:每个测序序列生成的g.vcf.gz的文件比较大,所用能一下子生成所有的g.vcf.gz文件,所以只能先生成一部分g.vcf.gz文件进行合并成vcf.gz文件,然后在生成另外一部分vcf.gz 文件,那么我想问问 两批生成的vcf.gz文件可以合并吗,是不是生成vcf.gz文件后,第一批的比对数据都可以删除了?另外,我想问一下,怎么结束在后台运行的任务?

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1 个回答

omicsgene - 生物信息
擅长:重测序,遗传进化,转录组,GWAS

必须所有的GVCF都生成一起合并,不能分批合并; 生成了gvcf文件之后,bam文件后续不用可以删除;

后台任务杀死可以用 ps -xf 查看任务PID 然后用kill杀死任务,如果用我们的服务器,登录的时候有个使用手册建议看看有说明;

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  • 随风 提出于 2025-01-06 13:39

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