重测序

那照这么说,你们独享服务器A只有128内存,56线程,并行运行去call 山羊SNP, 怎么设置比较合理?那在运行的时候就要减少分配的内存了,一个任务分给20G,同时运行5个任务可以把?不知道分给20G的内存够不够? 这并行运行和直接分给100G 一个任务运行,速度有差别吗?


nohup ParaFly -c  w.sh -CPU 5 > w.sh.o&

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1 个回答

omicsgene - 生物信息
擅长:重测序,遗传进化,转录组,GWAS

一般内存你尽量多设置一些,任务需要多少内存那个命令代码会自己处理,你不需要考虑那么多;你关心你所有任务总的内存使用情况即可,内存爆了,你减少任务量即可; 

有些情况自己多跑任务,慢慢积累经验就知道了;

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  • 随风 提出于 2025-01-07 11:48

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