去除物种特有的基因后作图,发现,仍然存在物种特有基因,不清楚是什么原因造成的
下次提问的时候可以贴一下你执行的指令,
perl $scriptsdir/PAV_list.pl -pangenel maize.WRKYgene.pan-genes.list -spid new_id2.txt -unigenel t -fam WRKY
你要注意,这个 t 文件应该是空的,这样你重新生成的PAV_draw.list里面才不会有物种独有的基因,还有一种原因,是你原来的泛基因列表文件中就有这样的情况,即一个泛基因编号下只有一个同源基因,可以排查一下