请问我想注释出碳氮磷硫功能基因及丰度,有什么教程吗

就是具体到 mirC基因丰度之类的

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1 个回答

xun - 电路元件工程师

单独的教程没有,但是逻辑不复杂,以kegg为例,主要难点在于碳氮磷硫功能相关通路的不一定找的全,比如碳代谢应该有很多相关的,比如Carbohydrate metabolism应该基本相关的,但是比如Energy metabolism里的Carbon fixation by Calvin cycle和Methane metabolism 应该也是,可能要自己筛选一下,而且需要统一,比如Carbohydrate metabolism是第二层级,有点宽泛,你可能需要把他包含的第三层级的通路名字拿出来筛选,

找完以后这些通路包含的基因就是你需要的基因,然后去之前得到的丰度文件里找到这些基因对应的丰度就可以了

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  • George 提出于 2025-02-05 10:42

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