你检查一下pairid文件里面的基因对有没有正常生成，如果只有一个基因是成不了对的，还有检查一下你的pep和cds文件，是不是正常的，如果你的基因序列没有提取成功，后面做分析的时候也会有问题
老师，这是提取的CDS文件
老师，这是提取的CDS文件