在去宿主那一步，生成bowtie.sam和fin.sam文件的时候，可不可以分别做2个，就是因为测序批次问题，可不可以分开2次进行去宿主生成.sam文件，然后前后2次所有的文件放在一个文件夹里，一起进行下一步？

还有，组装的时候，可不可以单样本组装的时候，因为测序批次问题，可不可以分开2次进行组装，然后分别组装完以后，放在一个文件夹里进行后续步骤？