10 参考咱们的T2T组装课程 进行基因组组装后,染色体出现了一个超级染色体,各染色体大小分布非常不均匀

根据测序得到的pacpiohic数据,根据咱们的T2T课程,主要利用hifiasmAllhic软件进行初步组装和染色体挂载,结果显示19条染色体大小极不均匀,出现了一条超级染色体,如下图:希望帮忙看看分析代码问题(附件:1组装流程简化.sh),下文为简单的分析流程总结。

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最佳答案 2025-03-05 10:42

图没有贴出来,也没看到分析流程总结。大小不均匀可以看一下近缘物种是否存在这个现象。超级染色体内部Hi-C信号都很强吗?可以根据3D-DNA的juice box进行手动的切割划分试试

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其它 1 个回答

xiaoer

问题咨询(1).docx1组装流程简化(1).sh

老师好,组装流程和问题以用附件形式上传,近缘物种染色体之间比较均匀

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  • xiaoer 提出于 2025-03-04 09:21

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