同学，这个cat指令主要是占用内存和OI，和存储关系不大吧。
2 个回答
不需要执行这么复杂的操作，“cat ../01.jcvi/pangene_filter.*.last | grep -v "^#" > last.txt”，这一步是为了合并所有的比对文件并且删除掉"#"开头得行，主要是为了下一步去执行python的脚本。那你不合并，直接从原来的last文件里面删除 "#"开头的行，然后执行python的脚本就可以了。
for i in `find ../01.jcvi -name "pangene_filter.*.last"`;do
name=`basename ${i} | cut -d "." -f2`;
grep -v "^#" ${i} > ${name}.last;
python3 $script/find_1vs1_v2.py ${name}.last ${name}.txt && rm ${name}.last;
done
做完这一步之后，如果没有问题，你可以把前面的pangene_filter.*.last也删了，在03文件夹里面继续执行这样的步骤：
cat *.txt > last.txt
python3 $script/find_1vs1_v2.py last.txt 1vs1.txt
从109行再往下执行。