lefse分析细节

当进行多组间lefse分析时,每组得到的lda score分数高的,是不是就是这组比其余组显著高的微生物物种,这样会不会忽略掉这组显著低于其余组的微生物物种?attachments-2025-03-7zlIvGjP67d116e309273.png



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1 个回答

xun - 电路元件工程师

不对,应该这样说,
lda score, 代表的是一个物种在区分某组和其他组时的能力大小
丰度很低低的lda score也高,

只不过坏处事你不知道他到底是高还是低,所以可以结合那个丰度图看,就是不同组相对丰度的图

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  • murakami 提出于 15小时前

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