老师您好,我在运行collapse_samples.py这段代码用于物种注释时出错,出错信息为 qiime.parse.QiimeParseError: No header line was found in mapping file.请问该如何解决?

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2 个回答

xun - 电路元件工程师

你的group.txt这个文件没有表头,前面的代码都执行了吗,你看一下他最上面的一行是不是#开头的,
如果不是这个问题,那就是metadata的写法不对,需要和课程里提供的格式完全一样

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大言子

老师,我仔细核对了代码,也重新运行了一遍,还是出现了这个问题,以下两种metadata格式都不行

SampleID g1 g2 g3

ER_CK_MAOM_1 1 CK m

ER_CK_MAOM_2 1 CK m

或者

SampleID group

ER_CK_MAOM_1 CK

ER_CK_MAOM_2 CK


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  • 大言子 提出于 4天前

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