关于填充gap后的polish

我基于hifi和ont还有hic进行了基因组组装,挂载后通过ont组装的基因组进行了gap填充,gap从11个变为了7个,但是进行polish后直接没有gap了,这个结果可信吗?

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1 个回答

Ti Amo

polish用的是什么软件呢?只使用了三代数据进行抛光吗?抛光完成之后和参考基因组或者和之前的组装做比对的话,共线性差异大吗?基因组减小了多少呢?可以采用racon对7个gap的组装重新做一下抛光。

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  • 陈黑手 提出于 2025-04-11 11:14

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