你为什么要替换你的库文件的内容呢，你直接用库文件做注释就行了，脚本里这里也没有让你修改ID：
老师，我正在做泛基因家族分析的结构变异与基因注释部分，出现一些错误
老师，我正在做泛基因家族分析，结构变异与基因注释部分，#转换gff3到genePred 格式并转换转录本格式至基因ID，尝试了不同的指令，均未能成功修改 sed -i "s/\\.[0-9]*$//" ${ref}_refGene.txt ，之后在excel中完成修改，结果如下：
之后，#建立注释库
retrieve_seq_from_fasta.pl --format refGene --seqfile ${ref}.fa ${ref}_refGene.txt --out ${ref}_refGene.fa ，在此过程中出现许多错误并得到最终的${ref}_refGene.fa，请老师帮忙看看是否正常
