5 flexbar2.2去接头的时候遇到的报错问题

代码如下:

[root@iZbp10cjxe9c7ip0m4hzhwZ work]# flexbar --adapter-min-overlap 7 --adapter-trim-end RIGHT --adapters /root/demo/refs/illumina_multiplex.fa --phred-pre-trim 13 --max-uncalled 300 --min-readlength 25 --threads 1 --source /root/demo/data/HBR_Rep1_ERCC-Mix2_Build37-ErccTranscripts-chr22.read1.fastq.gz --source2 /root/demo/data/HBR_Rep1_ERCC-Mix2_Build37-ErccTranscripts-chr22.read2.fastq.gz --target /root/demo/data/work/2.trimmed_data/UHR_Rep1_ERCC-Mix1_Build37-ErccTranscripts-chr22 --format csfastq

报错如下:

attachments-2018-07-AziyAPXD5b4fe794c18de.jpg

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最佳答案 2018-07-19 13:47

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  • Ideal 提出于 2018-07-19 09:22

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