5 Hisat2 比对准确比对到一次的比率过低是哪里出了问题?

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最佳答案 2018-08-24 10:00

 整体的比对效率还是挺高的,达到了94.06 %,但多比对的比例比较高,占了26.78% 。  

原因可能有:

1. 基因组为多倍体,一条序列能比对到多个染色体位置

2. 同源,重复序列较多

3. 高表达的基因存在多个位置

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  • 陈慕雅 提出于 2018-07-24 09:59

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