最近在写一篇基因家族的文章，想研究基因家族成员的基因的表达情况，但是又没有时间做定量PCR，所以想在网上下载别人相关转录组测序的文件来自己分析，生成热图。我目前正在学转录组数据挖据这门课程，里面好像没有涉及到表达量数据的过滤，校准和聚类方面的知识。请教一下，我想从网站上下载别人发表文章的转录组数据或者基因芯片数据，针对我研究的基因进行表达量分析，在组学课堂里的那门课程涉及这方面的内容呢？多谢指点迷津，小白一枚。（图片中就是一个人利用网上别人发表的转录组数据，整理后得到了自己研究的基因的表达量）
你下载的数据是原始数据，所以你还得过滤然后比对参考基因组（有参），计算基因表达量，没有生信基础，估计个人做不了，还是建议做实时定量！
5 转录组学习中遇见的问题
2 个回答
从您的需求来看，你需要做两件事情：
1. 下载测序数据，进行表达定量分析，这个可以学习一下《RNAseq有参转录组数据自主分析》这个课程
2. 对表达定量的结果进行可视化展示，也就是绘制热图，你目前学习的《转录组标准分析后的数据挖掘》中就有热图的绘制方法
你下载的数据是原始数据，所以你还得过滤然后比对参考基因组（有参），计算基因表达量，没有生信基础，估计个人做不了，还是建议做实时定量！
从您的需求来看，你需要做两件事情：
1. 下载测序数据，进行表达定量分析，这个可以学习一下《RNAseq有参转录组数据自主分析》这个课程
2. 对表达定量的结果进行可视化展示，也就是绘制热图，你目前学习的《转录组标准分析后的数据挖掘》中就有热图的绘制方法