pacbio 三代全长转录组数据分析流程 Iso-Seq 3
您好，看了您发的《pacbio 三代全长转录组数据分析流程 Iso-Seq 3》的帖子，受益很多。我自己也刚接触三代测序的数据，现在是拿到原始数据了，做得是无参物种，做到“lima ccs.bam barcoded_primers.fasta demux.ccs.bam --isoseq --no-pbi”的时候，发现我的文件里没有barcoded，但是有一个adapter.fasta文件，我将adapter作为输入文件时，报错为“RROR: Barcode names must contain either '3p' or '5p' suffix!",修改后缀名后依旧报错，不知道您这里有没有可以解决的方案推荐，如果你能百忙之中解惑，感激不尽。刚注册进来，没有金币可以送给您，实在不好意思！
最佳答案 2019-03-05 20:20
接头序列的文件内容应该是如下格式：
>primer_5p
AAGCAGTGGTATCAACGCAGAGTACGGG
>primer_3p
GTACTCTGCGTTGATACCACTGCTT
