15 怎样获取全基因组的蛋白序列

一般物种的基因组序列、注释文件gtf、CDS序列、蛋白序列都可以同时下载到。

但是有些物种基因组复杂,未能组装到染色体水平,只是组装到一些scaffolds,而且不能下载全基因组蛋白序列。请问,怎样根据注释信息获取这些物种的全基因组蛋白序列呢?拜托各位指导一下。

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最佳答案 2019-03-14 20:47

组装之后的基因组,肯定有蛋白质序列和cds序列,你再找找吧。

不然你需要写程序根据gff注释信息从基因组截取cds序列,再翻译出蛋白质;

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  • Angelo 提出于 2019-03-05 22:35

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