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利用GATK 分染色体call 变异时出现错误

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宏基因组分析老师上课的内容。

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根据没有标识转录本是1还是2或3的IDlist基因号名单，在标识了转录本的蛋白质序列文件中搜索，可以把IDlist名单中的所有转录本蛋白序列搜索出来吗？可以改命令达成？这是我的命令seqkit grep -f Nramp_IDlist_final.txt arahy.Tifrunner.gnm1.ann1.CCJH.protein.faa -o Nramp_pep_final.fa 我把IDlist里面名单后面都加了转录本号才搜出来。？

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GATK 很慢，怎样分染色体CALL 变异

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我在做T2T，docker下载T2T镜像错误

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老师，我正在做泛基因家族分析的结构变异与基因注释部分，出现一些错误

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基因家族分析之基因结构分析

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20 GFF文件格式不标准

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泛基因家族鉴定-找不到Bio::SeqIO模块

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宏基因组数据预处理问题

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windows10安装docker后，输入命令，报错，请问如何解决？

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代谢组数据正态检验

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老师上课的内容，为什么我的demo里面没有东西？

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基因家族生信

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文献给的下载基因组网站下载不了花生基因组数据，ensemble下载的信息又不全，咋整啊，老师?

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我鉴定的家族成员的基因ID和已经发表文献的基因ID不一样，如何让两者对应起来？下图左侧是文献中的基因ID，右侧是我鉴定出来的基因ID，数量一致。

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lefse分析细节

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老师，我正在做泛基因家族分析的系统发育树构建，构树过程中，出现以下的过程及警告，请老师帮忙看看是否正常，这些重新序列的编号是否有影响（序列对其修剪后有重复名称已去除），以及我下面的系统发育树这么多是否正常，还是需要筛掉一些？

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老师您好，我在提取cds的时候报错了。他说第84行出错，然后我打开看了，感觉看不出什么问题呢老师

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A基因家族的家族成员一共25个，但是23个成员是一个domain，只有是两个domain,这种情况，比较这个基因家族里面不同成员的蛋白全长是不是不合适？不容易得到25个成员的全蛋白进化树？