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GWAS中gapit分析没有结果，命令行输入与屏幕输出如下

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tassel报错：net.maizegenetics.pipeline.TasselPipeline - TasselPipeline: parseArgs: expecting argument beginning with dash: tree/out.recode.vcf

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tassel跑glm模型报错et.maizegenetics.pipeline.TasselPipeline - TasselPipeline: parseArgs: expecting argument beginning with dash: importGuess

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我在进行变异结果质控过滤，去掉低质量的变异结果发现我材料的变异结果都是0

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https://snp-seek.irri.org/_download.zul从这个网站下载全基因组测序文件，进行GWAS分析，下载哪几个啊

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gwas分析群体画进化树

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使用tassel软件对vcf文件排序时出现ERROR net.maizegenetics.plugindef.AbstractPlugin - java.lang.IllegalArgumentException: AlleleDepthUtil: depthIntToByte: Can not have negative depth values: -8448

  • mike 2024-03-18 16:27
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老师，我在做PCA时，显示软件在环境变量中没找到，但是里面显示是有的，请问这是因为什么呢？怎么解决？

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gwas

  • Jay 2024-06-28 14:50
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3 利用代码进行曼哈顿图制作中报这种错误，应该如何解决？

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老师您好我想问一下做GWAS分析，我的物种是异花授粉植物，我要研究它的种子油脂的相关性状，我是用叶片还是用种子的胚更好

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单倍型分析报错

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在做GWAS关联分析，利用gapit软件发现不同模型产生的hd.$m.GWAS.Results.txt一模一样

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怎么过滤vcf文件中INFO列中的DP参数？

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3 GWAS计算表型数据blup时一直出错

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在用gemma分析gwas时，调用perl脚本中的sort_trait.pl，发生报错，请老师帮忙解答，谢谢老师。

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感兴趣的区域LD热图不包括indel位点？

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在用gemma进行亲缘关系矩阵计算时，已经給fam文件添加表型但还是报错

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关于基因受选择计算

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tajimaD pi绘图