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3 请问，在3个数据库中进行结构域确认时，为什么我出不来和老师一样的结果，是不是使用的_pep_need_to_confirm.fa文件里面基因名称一行需要修改？

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5 请问利用jcvi整理泛基因列表，做JCVI做共线性分析时，一直提示/bin/bash: lastdb: command not found，是没有安装Last软件包吗？目前使用的镜像是购买课程时老师提供的，数据是26个玉米基因组数据（由于空间不足，只用了19个基因组）

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3 gff3_file_to_proteins.pl 报错

  • Dg 2025-01-10 16:59
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5 docker打不开镜像

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3 是否可以将同源聚类的结果命名成TPS1/2/3

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5 如何自己制作泛基因组的pangene.list呢

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3 关于泛基因组的pangene.list

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5 泛基因家族docker报错

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10 老师，下载镜像报错怎么办？

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15 一个基因家族包含两个结构域，对应interpro数据库两个hmm模型文件，请问怎么同时鉴定包含以上两个结构域的家族成员？

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10 使用NCBI下载的基因组和gff文件进行基因家族分析时，保留编码蛋白基因的命令似乎无法识别NCBI的gff文件（描述中为日志，图片为尝试获取的gff文件）

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20 您好我用OrthoVenn和拟南芥做同源比对，结果我应该下载哪一个去做string网站上的比对，构建ppi

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5 蛋白三级结构分析时，用PSI-blast和SWISS-MODEL自带的模板同时做了，发现SWISS-MODEL自带的模板做出来的相似度更高、GMQE和QMEAN值也更好，同时，两个方法也有重复的模板，想问问老师应该选择相似度更高的，还是选择两种方法都有的模板？

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5 老师你好，我在用w.sh里面的第二次搜索结构域命令的时候出现报错（下图），请问如何解决

  • BIO 2024-05-17 16:55
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5 经旋转调整后evolview进化树依然出现分支节点跟mega11不匹配的问题

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10 请问在自己进行手动比对鉴定基因家族的时候最正确的做法是什么？

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10 SMART网站手动确定结构域没有结果

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10 提取CDS序列失败！！!

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10 保留蛋白编码基因一直错误!!!

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10 基因家族鉴定方法和BITACORA相比哪个更好？