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构建进化树bootstap值自动变动及结构域的选择
tree
MEGA
程子贪吃猕猴桃
2019-08-09 21:38
2
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5
老师,您好!我用mapchart构建染色体图时,构建的图好像不太对,数据检查没问题,到底是哪里错了,还是因为软件的文件丢失,如果是软件的问题是需要重新下载吗?
瀞.湉颜
2019-08-07 18:01
2
解决
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5
串联重复基因定义
tandem
segmental
余生
2019-08-07 15:58
1
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3458
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5
在做无参考基因组的基因家族分析时,我能否用hmm方法用pfam号筛选全长转录组的di19家族成员
基因家族
[玺]
2019-08-02 12:36
2
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3599
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5
请老师帮忙看看为啥一样的操作,将anchors.simple更新了基因家族的数据进去就做不出来图了,不添加基因家族信息可以作图,而且名字改了 对应的mcsacn.layout 也改了
比较基因组学作图
python版mcscan
MCScanX
FIFA
2019-07-29 18:45
1
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2282
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5
老师,我按照您的方式把序列路径也填上了,可还是没读进去,帮忙再看看,谢谢
[玺]
2019-07-29 18:13
2
解决
4690
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5
我的转录本数据和gene ID不一致,所以我用的转录本ID来做的circle绘图,但是进行不下去
Circos
FIFA
2019-07-28 22:05
1
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3116
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5
我下载了Mac版的clustalW的软件可是在第一步输入序列上出现问题,序列输不进去,希望能帮忙解答,谢谢
[玺]
2019-07-27 23:57
2
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4350
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5
用TBtools组合进化树、motif时出现了下面的情况,请老师指导
TBtools
FIFA
2019-07-27 08:36
1
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10
MAGEcc跑进化树
MEGA
tree
Angelo
2019-07-25 11:14
2
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4520
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5
基因ID和transcript ID 命名的方法不一致,导致了做出来的基因结构图出现了多个转录本结果 请老师指导,谢谢
FIFA
2019-07-24 19:02
1
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3748
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5
老师好,我在虚拟系统中筛选出53个基因,去两个网站上比对结构域,结果不同且差异较大,我选择了pfarm网站中的53个基因。但是再构建进化树时用邻接法却提示我序列差异太大,画不出来。然后我删掉了序列很短的基因6个。就画出来了。请问老师,我是应该筛掉基因还是用最大简约法画树。希望老师指导。谢谢!
pfam
网名
2019-07-23 09:57
1
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2688
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5
提取蛋白结构域序列文件出错
lotus
2019-07-22 18:37
1
回答
6420
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5
MEGAx用MUSCLE比对时出现错误
MEGA
土桑的森桑
2019-07-22 18:00
3
回答
4981
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5
Erro基因家族分析报错:TC bit thresholds unavailable on model domain;如何解决
hmmer
Calvin Klein
2019-07-22 10:31
1
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3375
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5
请教一下geneid2mRNAid文件生成出现的问题
perl
Li
2019-07-21 15:47
1
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10
老师您好,我线下上过您的基因家族培训课程,目前在尝试用大豆基因组进行分析,但我发现从ENSEMBLEPLANT下载的基因组序列格式跟拟南芥的注释格式不一样,我已经尝试着进行了 一些编辑,但还是无法统一ID,麻烦您帮我解决一下这种基因组注释格式修改问题
2019-07-21 14:38
2
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3518
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5
#运行MCSCANX 查找共线性 /biosoft/MCScanX/MCScanX/MCScanX mcscan/AT 出错
共线性分析
王世民
2019-07-21 13:44
1
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3403
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5
第一次hmm搜索时可以搜索出序列,但是接下来一步提取结构域序列时出来的文件是空的
hmmer
smile悠然
2019-07-20 11:18
1
回答
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5
提取不出来结构域序列
hmmer
smile悠然
2019-07-20 11:13
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