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5 共线性分析

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5 MCSCANX共线性图代码报错,看了其他提问和回答没能解决。

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5 如果研究的基因家族没有已知的结构域domain怎么办？

  • 2019-01-23 18:04
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10 为什么我按照其他文献中确定的基因下载下来的基因家族，把这些在序列比对，没有他文章中比对的那么整齐呢，都是相同的基因ID,比对方法也一样，我构建进化树的时候，是按照其他文献中确定的基因直接下载下来和我研究的一块构建吗，还是另有其他的方法

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5 老师，Blastall 报错的问题

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5 ORF (bp) ，domain starteend，Sub-cellular localization和No. of introns怎么找

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5 clean_result结果是空的

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5 老师，我用的拟南芥示例文件，完全按照老师讲解的步骤，但是在新构建.hmm文件后，再用hmmsearch搜索家族成员时报错是怎么回事？

  • liu 2019-01-13 21:34
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5 老师你好，我想问下，在做基因家族分析时，我的无参转录本里的unigene是核苷酸序列，不是蛋白质序列，这种情况应该怎么办呢？

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5 你好，请问你是做无参转录组基因家族分析吗？我想请问下，你做基因家族成员鉴定时，用的哪个文件，我看到那个课程里用的是蛋白质序列，但是我的转录本unigene里面是核苷酸序列，请问你是用什么文件做的基因家族成员鉴定呢？

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8 氨基酸序列比对之后，gaps太多，mega一直出错，删除之后依然如此，如何很好构建系统发育树

  • 2019-01-11 23:02
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5 老师好，在基因家族分析课程视频里，鉴定基因家族成员时，里面实操用的是基因组的蛋白质序列（pep文件），然而我自己的实验数据是无参转录组，我想问下，我应该用什么文件来鉴定基因家族成员呢？我看到之前有类似问题的答案是unigene或者蛋白质序列，两者有什么区别呢？

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3 我用CIRCOS画图，文字标签叠加了要怎么弄到同一水平？

  • 2019-01-09 17:12
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5 利用蛋白ID获取基因ID时 所获得文件少一列

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5 关于基因家族中的串联重复基因的删选、Ka/Ks的计算、串联重复基因Circose图的分析有相关的文献吗？

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5 基因家族成员如何取舍，命名？如何查找外显子和内含子结构？

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5 基因家族分析 hmmer 第四讲

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5 绘制circos提示错误

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5 问一下老师 做基因家族分析 用新生成的hmm文件做hmmsearch 报 TC bit thresholds unavailable的错

  • .、 2018-12-20 11:37
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5 麻烦求助，在使用ncbi_gff_2_Ensembl_gff.pl这个脚本的时出现报错显示：cant find the string terminator "Usage end"...in line 10